花咲蕾是一个热爱花卉、非常了解花卉知识的初二学生某天随着父母搬家来到“希望花市”的途中花咲蕾做了一个奇怪的梦梦中的她站在一棵名为“心之大树”的树前看着光之美少女与暗之美少女战斗并被打倒而大树上的花朵瞬间全都枯萎了此时有只妖精从树中窜出蕾也从梦中惊醒了不料某天放学后梦中出现的妖精竟然出现在她的眼前并希望花小蕾可以成为传说中的战士“光之美少女”来帮忙打倒敌人让人类之心的源头“心之大树”可以再恢复到之前繁花盛开的模样并让大家的“心之花”绽放而战但蕾犹豫了就在此时不明的敌人出现了并将魔爪伸向了同班好友来海绘里香为了拯救好友花咲蕾决定要成为光之美少女之后好友来海绘里香、学生会长明堂院树以及曾将的光之美少女月影百合纷纷加入进来和蕾一起成为了光之美少女为拯救“心之大树”粉碎沙漠使徒征服世界的野心而战斗