平凡小镇生活在五口之家的普通小学生高町奈叶（田村由香里 配音）与好友月村铃鹿（清水爱 配音）和爱丽莎·巴尼斯（钉宫理惠 配音）过着无忧无虑的生活这一日她们偶然发现一只类似水貂的动物尤诺·斯克莱亚（水桥香织 饰）受伤的尤诺得到奈叶等人的救助谁知接下来小镇便连续出现各种怪物在尤诺的帮助下奈叶利用Rising Heart变身成为魔法少女击败了入侵的怪兽并且得知关于能量结晶快Jewel Seed的秘密以及自己的使命此后的日子里她为了成为合格的魔法少女背着好友们展开修行这一晚神秘魔法少女菲特·泰斯特罗莎（水树奈奈 配音）突然出现与奈叶展开激战　　她们之间的夙缘由此展开……