新学期开始美墨渚和雪城穗乃香成为菲诺奈学院女子中学部三年级学生过着普通女孩的校园生活　　而梅普鲁、米普鲁和保伦在上次战斗后陷入了漫长的沉睡　　此时在光之园在激战后受了伤的女王分裂成数个部分消失在远处与此同时渚和穗乃香遭到了萨凯那的袭击　　突然梅普鲁和米普鲁苏醒过来两人使用新的变身器再一次变身成为“光之美少女”不仅衣服改变了而且力量居然也提升了　　为了让失去了记忆和原本姿态的女王恢复原样渚和穗乃香以及苏醒后力量得到提升的梅普鲁、米普鲁和保伦将与不可思议的少女?九条光一起展开新的故事　　光之美少女们能够让女王恢复原来的样子吗