2000年血腥除夕夜贤知（唐泽寿明 饰）一派拼尽全力阻挠“朋友”的人类灭绝计划但他们的反抗以失败告终是夜过后贤知一派被诬为屠杀人类的恐怖分子而“朋友”则堂而皇之成为了救世主为万众膜拜和敬仰　　2015年贤知的甥女远藤神乃（平爱梨 饰）已成长为特立独行的青春女孩她十分反感教科书对舅舅的污蔑经常和老师发生争论最终校方决定将她和另一位曾对血腥除夕夜提出质疑的女孩小泉响子（木南晴夏 饰）送入“朋友乐园”与此同时曾在“朋友乐园”接受改造的异装癖男子偶然得知“朋友”的秘密被警方杀害目睹这一幕的神乃决定进入“朋友乐园”一探究竟　　另一方面新的万国博览会将在日本召开罗马教宗亦会在此时造访日本被关在萤火虫集中营的阿区（丰川悦司 饰）越狱而出贤知一派幸存的同志们纷纷聚首在这个暗潮汹涌的时刻人类的命运将再次改写……　　本片根据浦泽直树同名漫画改编　　（影片简介中涉及的人名均以原著漫画中文版翻译为准）